印尼北部廖內 (Riau) 省Pekanbaru地區於本年9月6日發生一名33歲男子因禽流感死亡之案例，使印尼因禽流感死亡之人數增加至85人，並為全球因禽流感死亡最多之國家。

此外，印尼中爪哇省禽流感疫情亦繼續漫延，該省Purbalingga縣2個鄉村數十隻雞近日突然死亡，該省畜牧暨漁業局派遣工作小組前往進行檢查，證實感染禽流感病毒，該局抗禽流感小組立即派員對當地居民提供輔導，並對雞棚進行消毒。

印尼人常將雞隻養在住家後院，與人們活動地點非常接近，由於禽流感為印尼各地為相當普遍禽類疾病，醫療專家耽心其病菌可能發生突變，變成一人傳人之疾病，引發嚴重之傳染病疫情，可以導致人類大規模的死亡。

印尼目前因禽流感死亡人數居全球首位，其度假聖地巴厘島最近亦發生一禽類傳給人導致死亡之案例，該地經常舉行國際會議，本年12月並將舉辦一項聯合國有關氣候變化之重要會議，估計屆時將有約1萬人出席，因此巴厘島政府亦格外重視禽流感疫情之防範，已採取包括集體噴灑、對鳥禽注射疫苗、撲殺疑似染病之家禽、及停止與巴厘島以外地區鳥禽交易等各項措施，以防止病毒傳入。

有關印尼禽流感疫情，該國衛生部長Siti Fadillah Supari駁斥美國新傳染病雜誌(U.S. Journal of Emerging Infectious Diseases)近日報導所稱，印尼蘇門答臘島2006年5月間發生8個家庭成員因禽流感而死亡實已呈現統計上人傳人疫情之說法，認此一說法將會誤導大眾。S部長說明稱，倘該說法屬實，則該傳染病早已傳遍全國，造成成千上萬人之死亡。印尼醫療專家早已確定蘇門答臘島當時情況並非人傳人案例，籲其國人勿須恐慌。